Лиственные леса занимают почти все среднегорье — от 1000 до 2000 м. В средней полосе лесного пояса, на высоте 1000— 1600 м, на южных склонах развиваются дубовые, а на северных склонах — буковые леса. На высоте 1900—2200 м обычны субальпийские леса, так называемые криволесья. Распространены также субальпийские луга. На самых высоких участках горных хребтов очень небольшие площади заняты альпийскими коврами и лугами. В заповеднике есть места, где возобновление леса после рубок происходило за счет граба. В настоящее время здесь широко представлены различные варианты грабового леса, в которых кустарниковый и травяной ярусы сохранились от коренных типов. Все это лишь часть описания флоры дилижанского заповедника. Она очень и очень богатая, впрочем, как и фауна этой территории. В заповеднике встречаются самые разные животные.
В лесном поясе есть амфибии и рептилии. Как правило, это квакша, веретеница и скалистая ящерица. Повсюду в лесах обитают кроты, обыкновенная и малая бурозубки. В зарослях кустарников, садах, огородах встречается обыкновенный еж. В реках и ручьях обитает водяная кутора, а на полях — кавказская длиннохвостая белозубка. Сравнительно богата фауна хищных млекопитающих: бурый медведь, волк, лисица, барсук, каменная куница, ласка, рысь, лесной кот. Очень редко появляется леопард. Немало здесь и грызунов — лесная мышь, кустарниковая полевка, персидская белка, соня-полчок и более редкая лесная соня. На разреженных участках леса и по опушкам иногда встречается заяц-русак. Ну а кабан, пятнистый олень и косуля — это обычное явление для этого заповедника. Кстати, косуля — абориген дилижанских лесов, кабаны и пятнистый олень прежде на территории заповедника не водились. В 1969 г. на эту территорию выпустили 60 кабанов и 130 уссурийских пятнистых оленей. Кабаны хорошо прижились в Агарцинском ущелье, размножились и даже заселили соседние с заповедником районы. Но кормом они обеспечены здесь не всегда, потому в неурожайные годы мигрируют, доходя до бассейна Куры. Не менее успешно прижились в заповеднике и пятнистые олени.
Ну а какой заповедник без птиц… Пернатых здесь около 120 видов. Из птиц распространены канюк, ястребы тетеревятник и перепелятник, черный коршун, малый подорлик, осоед, вальдшнеп, вяхирь, филин, серая неясыть, многие виды воробьиных и др.
Впрочем, Дилижанский заповедник известен не только своей флорой и фауной. На этой территории очень живописные места. Здесь большое количество интересных пещер, скал, ущелий и т.п. Одним из лучших является, бесспорно, Агарцинское ущелье. Ну а почти во всех более или менее крупных оврагах и ущельях протекают ручьи, речки. Бесчисленные ключи и родники питают эти небольшие притоки, которые вливаются в основную водную артерию заповедника — реку Агстев. А озеро Парз считается просто уникальным. Оно расположено среди густого леса на высоте 1400 м. Интересно, что подпитывают это безрыбное озеро ключевые родники, а зимой оно обычно не замерзает. Не менее живописны и другие озера заповедника — Гошалич, Бачнилич, Бахтиа рилич, Жанготлич и др. Но и это не все… Территория заповедника богата археологическими и историко-архитектурными памятниками. Здесь находятся такие выдающиеся памятники средневековья, как Агарцинский монастырь, Ахнабадская церковь, Гошаванк, Матосаванк, Джухтакванк и др. Сохранились следы древних поселений, старые кладбища, часовни, отдельные хачкары. Дилижанский заповедник — это красота, которую надо обязательно увидеть. Одним словом, лучше один раз увидеть, чем сто раз услышать или прочитать...